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根據(jù)《中華人民共和國(guó)海關(guān)對(duì)保稅物流園區(qū)的管理辦法》第十三條的規(guī)定，保稅物流園區(qū)行政管理機(jī)構(gòu)及其經(jīng)營(yíng)主體和園區(qū)企業(yè)從境外進(jìn)口貨物的有關(guān)規(guī)定照章征稅。
1.從園區(qū)運(yùn)往非園區(qū)的貨物，按照進(jìn)口貨物的辦理報(bào)關(guān)征稅手續(xù)；從非園區(qū)運(yùn)往園區(qū)的貨物，按照出口貨物辦理報(bào)關(guān)征稅手續(xù)。
2.根據(jù)《中華人民共和國(guó)海關(guān)審定進(jìn)出口貨物完稅價(jià)格辦法》第三十條的規(guī)定，從保稅區(qū)運(yùn)往境內(nèi)非保稅區(qū)需要征稅的貨物，海關(guān)以進(jìn)入國(guó)內(nèi)非保稅區(qū)的銷售價(jià)格為基礎(chǔ)確定完稅價(jià)格。如銷售價(jià)格中未包括所發(fā)生的倉(cāng)儲(chǔ)。運(yùn)輸及其他相關(guān)費(fèi)用的，應(yīng)當(dāng)按照客戶量化的數(shù)據(jù)資料給予計(jì)入。
3.進(jìn)入保稅物流園區(qū)的國(guó)內(nèi)出口貨物尚未辦理退稅手續(xù)的。因品質(zhì)或者規(guī)格原因需要退還出口企業(yè)時(shí)，園區(qū)企業(yè)應(yīng)當(dāng)在貨物申報(bào)進(jìn)入園區(qū)之日起1年內(nèi)提出申請(qǐng)，并提供出口企業(yè)所在地主管稅務(wù)部門出具的未辦理出口退稅證明，經(jīng)園區(qū)主管海關(guān)批準(zhǔn)后，可以辦理退運(yùn)手續(xù)，且無(wú)需繳納進(jìn)口關(guān)稅，井環(huán)節(jié)增值和消費(fèi)稅；海關(guān)已征收出口關(guān)稅的，予以退還，貨物以轉(zhuǎn)關(guān)方式進(jìn)入園區(qū)的，園區(qū)企業(yè)出具啟動(dòng)地海關(guān)退運(yùn)聯(lián)系單后，園區(qū)主管海關(guān)辦理相關(guān)手續(xù)。
4.已辦理出口退稅的貨物或者已經(jīng)流通性簡(jiǎn)單加工的貨物（包括進(jìn)境貨物）如需退運(yùn)，按照進(jìn)出口貨物的有關(guān)規(guī)定辦理報(bào)關(guān)手續(xù)
。
5.除已經(jīng)流通性簡(jiǎn)單加工的貨物外，區(qū)外進(jìn)入園區(qū)的貨物，因質(zhì)量、規(guī)格型號(hào)與合同不符等原因，需原狀返還出口企業(yè)進(jìn)行更換的，保稅物流園區(qū)企業(yè)應(yīng)當(dāng)在貨物申請(qǐng)報(bào)進(jìn)入園區(qū)之日起1年內(nèi)向園區(qū)主管海關(guān)申請(qǐng)辦理退換手續(xù)。更換的貨物進(jìn)入園區(qū)時(shí)，免領(lǐng)出口許可證件，免征出口關(guān)稅。
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